Кроме поддержки Патриарха ему было предъявлено обвинение в связи с оренбургскими контрреволюционными казаками и с англичанами.
Епископ Лука был одним из создателей Ташкентского университета, где до своего ареста преподавал и практиковал как профессор топографической анатомии и оперативной хирургии.
Служил в Ташкентском кафедральном соборе до 1923 г. Священническое служение сочетал с чтением лекций в университете и работой хирурга, поэтому в храме служил только по воскресениям. Ему было поручено все дело проповеди. Проводил по воскресениям беседы, на которые приходило много народу
В тюрьме ташкентского ГПУ он закончил свой, впоследствии ставший знаменитым, труд "Очерки гнойной хирургии"
В августе его отправили в московское ГПУ В Москве Владыка получил разрешение жить на частной квартире. Служил с Патриархом Тихоном литургию в церкви Воскресения Христова в Кадашах. Святейший подтвердил право епископа Туркестанского Луки продолжать заниматься хирургией.
В Москве Владыку снова арестовали и поместили в Бутырскую, а затем в Таганскую тюрьму, где Владыка перенес тяжелый грипп. К декабрю был сформирован восточно-сибирский этап, и епископ Лука вместе с протоиереем Михаилом Андреевым были отправлены в ссылку на Енисей. Путь лежал через Тюмень, Омск, Новониколаевск (нынешний Новосибирск), Красноярск.
Арестантов везли в столыпинских вагонах, а последнюю часть пути до Енисейска - 400 километров - в лютую январскую стужу им пришлось преодолеть на санях. В Енисейске все оставшиеся открытыми церкви принадлежали "живоцерковникам", и епископ служил на квартире.
Ему разрешили оперировать. В начале 1924 года, по свидетельству жительницы Енисейска, Владыка Лука пересадил почки теленка умирающему мужчине, после чего больному стало легче.
Всю войну он проработал в Тамбове хирургом и организатором помощи раненым. Здесь на его попечении находилось 150 госпиталей. За свои труды святитель был удостоен Сталинской премии первой степени, которую он передал детям-сиротам.
В 1995 году он был причислен к лику местночтимых святых а затем в 2001 году канонизирован Русской Православной Церковью как священноисповедник .
За 38 лет священства архиепископ Лука прочитал 1250 проповедей, из которых 750 записаны, и составили 10 томов машинописи. Определением Синода Украинской Православной Церкви от 22 ноября 1995 года архиепископ Симферопольский и Крымский Лука причислен к лику местночтимых святых.
Нравственные и этические принципы архиепископа Луки были заключены в лаконичной, но емкой мысли святителя: «Главное в жизни – всегда делать людям добро. Если не можешь делать для людей добро большое, постарайся совершить хотя бы малое».
Доктор медицинских наук профессор С. Вогулкин, настоятель Свято-Илиинского храма Екатеринбурга, заметил об ученом с мировым именем В. Ф. Войно-Ясенецком, архиепископе Луке: «Одна жизнь и одно служение, вместившие в себя несколько жизней и несколько служений, вместившие и отразившие всю трагическую историю России начала и середины ХХ в., оставившие неизгладимый след в науке и в духовной жизни нашей Родины».
www. kazac-center.ru